Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms