Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 542 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Gm12906-201ENSMUST00000154610 441 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Gm42511-201ENSMUST00000196160 234 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Gm11996-201ENSMUST00000117538 915 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Samd11Q1RNF8 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
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Samd11Q1RNF8 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Samd11Q1RNF8 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Samd11Q1RNF8 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms