Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Olfr1156-202ENSMUST00000216191 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms