Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
F13bQ07968 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
F13bQ07968 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
F13bQ07968 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
F13bQ07968 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
F13bQ07968 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
F13bQ07968 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
F13bQ07968 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
F13bQ07968 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
F13bQ07968 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
F13bQ07968 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
F13bQ07968 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
F13bQ07968 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
F13bQ07968 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
F13bQ07968 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
F13bQ07968 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
F13bQ07968 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
F13bQ07968 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
F13bQ07968 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
F13bQ07968 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
F13bQ07968 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
F13bQ07968 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
F13bQ07968 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
F13bQ07968 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
F13bQ07968 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
F13bQ07968 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
F13bQ07968 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
F13bQ07968 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
F13bQ07968 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
F13bQ07968 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
F13bQ07968 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
F13bQ07968 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
F13bQ07968 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
F13bQ07968 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
F13bQ07968 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
F13bQ07968 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
F13bQ07968 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
F13bQ07968 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
F13bQ07968 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
F13bQ07968 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
F13bQ07968 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
F13bQ07968 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
F13bQ07968 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
F13bQ07968 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
F13bQ07968 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
F13bQ07968 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
F13bQ07968 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
F13bQ07968 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
F13bQ07968 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
F13bQ07968 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
F13bQ07968 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
F13bQ07968 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
F13bQ07968 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
F13bQ07968 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
F13bQ07968 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
F13bQ07968 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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F13bQ07968 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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F13bQ07968 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
F13bQ07968 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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F13bQ07968 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
F13bQ07968 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
F13bQ07968 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
F13bQ07968 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
F13bQ07968 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
F13bQ07968 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
F13bQ07968 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
F13bQ07968 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
F13bQ07968 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
F13bQ07968 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
F13bQ07968 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
F13bQ07968 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
F13bQ07968 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
F13bQ07968 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
F13bQ07968 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
F13bQ07968 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
F13bQ07968 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
F13bQ07968 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
F13bQ07968 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
F13bQ07968 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
F13bQ07968 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
F13bQ07968 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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F13bQ07968 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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F13bQ07968 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms