Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MestQ07646 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MestQ07646 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MestQ07646 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MestQ07646 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MestQ07646 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
MestQ07646 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MestQ07646 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MestQ07646 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
MestQ07646 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
MestQ07646 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
MestQ07646 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MestQ07646 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MestQ07646 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
MestQ07646 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
MestQ07646 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
MestQ07646 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MestQ07646 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MestQ07646 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MestQ07646 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MestQ07646 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
MestQ07646 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
MestQ07646 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MestQ07646 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MestQ07646 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
MestQ07646 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
MestQ07646 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
MestQ07646 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
MestQ07646 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
MestQ07646 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MestQ07646 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MestQ07646 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MestQ07646 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MestQ07646 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MestQ07646 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
MestQ07646 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
MestQ07646 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MestQ07646 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MestQ07646 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MestQ07646 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
MestQ07646 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MestQ07646 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MestQ07646 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MestQ07646 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
MestQ07646 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
MestQ07646 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
MestQ07646 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
MestQ07646 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
MestQ07646 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
MestQ07646 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
MestQ07646 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
MestQ07646 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
MestQ07646 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
MestQ07646 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
MestQ07646 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
MestQ07646 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
MestQ07646 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
MestQ07646 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
MestQ07646 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
MestQ07646 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
MestQ07646 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
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MestQ07646 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
MestQ07646 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
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MestQ07646 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
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MestQ07646 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
MestQ07646 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
MestQ07646 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
MestQ07646 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
MestQ07646 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
MestQ07646 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
MestQ07646 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
MestQ07646 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
MestQ07646 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
MestQ07646 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
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MestQ07646 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
MestQ07646 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
MestQ07646 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
MestQ07646 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
MestQ07646 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
MestQ07646 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
MestQ07646 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
MestQ07646 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
MestQ07646 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
MestQ07646 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
MestQ07646 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
MestQ07646 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
MestQ07646 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
MestQ07646 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
MestQ07646 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
MestQ07646 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms