Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gdf3Q07104 Grb10-202ENSMUST00000109653 2048 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gdf3Q07104 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gdf3Q07104 4930488L21Rik-202ENSMUST00000212638 3164 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gdf3Q07104 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gdf3Q07104 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gdf3Q07104 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gdf3Q07104 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gdf3Q07104 Tesk2-202ENSMUST00000106456 2430 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gdf3Q07104 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gdf3Q07104 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gdf3Q07104 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gdf3Q07104 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gdf3Q07104 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gdf3Q07104 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gdf3Q07104 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gdf3Q07104 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gdf3Q07104 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gdf3Q07104 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gdf3Q07104 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gdf3Q07104 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gdf3Q07104 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gdf3Q07104 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gdf3Q07104 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gdf3Q07104 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gdf3Q07104 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gdf3Q07104 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gdf3Q07104 Ttc16-206ENSMUST00000161430 2874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gdf3Q07104 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gdf3Q07104 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gdf3Q07104 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gdf3Q07104 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gdf3Q07104 Cx3cl1-201ENSMUST00000034230 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gdf3Q07104 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gdf3Q07104 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gdf3Q07104 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gdf3Q07104 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gdf3Q07104 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gdf3Q07104 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gdf3Q07104 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gdf3Q07104 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gdf3Q07104 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gdf3Q07104 Slc27a5-201ENSMUST00000032539 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gdf3Q07104 Nectin4-203ENSMUST00000111286 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gdf3Q07104 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gdf3Q07104 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gdf3Q07104 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gdf3Q07104 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gdf3Q07104 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gdf3Q07104 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gdf3Q07104 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gdf3Q07104 Dcun1d2-202ENSMUST00000110838 2955 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gdf3Q07104 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gdf3Q07104 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gdf3Q07104 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gdf3Q07104 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gdf3Q07104 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gdf3Q07104 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gdf3Q07104 Man2c1-211ENSMUST00000160147 3820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gdf3Q07104 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gdf3Q07104 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Gdf3Q07104 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Gdf3Q07104 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Gdf3Q07104 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gdf3Q07104 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gdf3Q07104 Pgf-201ENSMUST00000004913 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gdf3Q07104 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gdf3Q07104 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gdf3Q07104 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gdf3Q07104 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gdf3Q07104 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Traip-201ENSMUST00000049348 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 A630052C17Rik-201ENSMUST00000129876 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Mitf-201ENSMUST00000043628 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Cr1l-204ENSMUST00000193094 2776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms