Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Gm14913-201ENSMUST00000120011 1093 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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NfiaQ02780 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
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NfiaQ02780 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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