Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
SeleQ00690 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SeleQ00690 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
SeleQ00690 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SeleQ00690 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeleQ00690 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeleQ00690 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeleQ00690 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeleQ00690 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeleQ00690 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeleQ00690 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeleQ00690 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeleQ00690 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms