Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Nbr1P97432 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nbr1P97432 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Nbr1P97432 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
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Nbr1P97432 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Nbr1P97432 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Nbr1P97432 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nbr1P97432 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nbr1P97432 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Nbr1P97432 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nbr1P97432 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nbr1P97432 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nbr1P97432 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nbr1P97432 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nbr1P97432 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nbr1P97432 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nbr1P97432 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nbr1P97432 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nbr1P97432 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nbr1P97432 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Nbr1P97432 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nbr1P97432 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Nbr1P97432 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nbr1P97432 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nbr1P97432 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Nbr1P97432 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Nbr1P97432 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Nbr1P97432 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Nbr1P97432 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Nbr1P97432 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nbr1P97432 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nbr1P97432 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nbr1P97432 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nbr1P97432 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nbr1P97432 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Nbr1P97432 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Nbr1P97432 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Nbr1P97432 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Nbr1P97432 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms