Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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