Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Arf1P84078 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Arf1P84078 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Arf1P84078 4931406P16Rik-202ENSMUST00000108074 6224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Arf1P84078 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Sgcz-201ENSMUST00000118896 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Wnk1-224ENSMUST00000203030 8163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Arf1P84078 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Arf1P84078 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Son-204ENSMUST00000119368 7529 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Arf1P84078 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Arf1P84078 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Gm45501-201ENSMUST00000211468 2526 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms