Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Irx1P81068 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Gm43143-201ENSMUST00000196083 2023 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Irx1P81068 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Irx1P81068 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Irx1P81068 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Irx1P81068 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Irx1P81068 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Irx1P81068 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Irx1P81068 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Irx1P81068 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Irx1P81068 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Slc6a9-202ENSMUST00000063857 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Irx1P81068 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Irx1P81068 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms