Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Usp9xP70398 AC124613.1-201ENSMUST00000198711 88 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Usp9xP70398 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Usp9xP70398 Olfr985-201ENSMUST00000060345 1116 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Usp9xP70398 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Usp9xP70398 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp9xP70398 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp9xP70398 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp9xP70398 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp9xP70398 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp9xP70398 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp9xP70398 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp9xP70398 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp9xP70398 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp9xP70398 Gm20831-201ENSMUST00000177639 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp9xP70398 Ssty1-202ENSMUST00000186035 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp9xP70398 Gm20737-202ENSMUST00000187245 1338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp9xP70398 Gm20777-202ENSMUST00000187434 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp9xP70398 Gm20873-202ENSMUST00000187857 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp9xP70398 Gm20772-201ENSMUST00000188928 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp9xP70398 Gm21310-202ENSMUST00000189630 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp9xP70398 Gm20795-202ENSMUST00000190909 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp9xP70398 Gm21454-202ENSMUST00000192204 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp9xP70398 Gm21440-201ENSMUST00000192749 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp9xP70398 Gm20831-202ENSMUST00000194411 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp9xP70398 Gm20807-201ENSMUST00000194687 1336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp9xP70398 Gm21425-202ENSMUST00000195626 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp9xP70398 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp9xP70398 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp9xP70398 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp9xP70398 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp9xP70398 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp9xP70398 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp9xP70398 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp9xP70398 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp9xP70398 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp9xP70398 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp9xP70398 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp9xP70398 Gm15886-201ENSMUST00000123155 1250 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp9xP70398 St8sia3os-204ENSMUST00000140903 383 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp9xP70398 Gm3298-202ENSMUST00000172110 615 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp9xP70398 2810049E08Rik-201ENSMUST00000185600 1102 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp9xP70398 Ighv5-8-202ENSMUST00000191967 337 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp9xP70398 D5Ertd605e-201ENSMUST00000201128 1081 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp9xP70398 Mylpf-206ENSMUST00000206772 653 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp9xP70398 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp9xP70398 AC159261.1-201ENSMUST00000222493 911 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp9xP70398 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp9xP70398 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp9xP70398 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp9xP70398 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp9xP70398 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp9xP70398 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp9xP70398 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp9xP70398 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp9xP70398 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp9xP70398 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp9xP70398 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp9xP70398 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp9xP70398 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp9xP70398 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp9xP70398 Selenbp2-204ENSMUST00000173849 1323 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp9xP70398 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp9xP70398 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp9xP70398 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp9xP70398 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp9xP70398 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Cyp2a21-ps-201ENSMUST00000206638 1471 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Ccm2-203ENSMUST00000109722 1760 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 AA623943-201ENSMUST00000121794 354 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Tnnc1-202ENSMUST00000169169 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Cd9-ps-201ENSMUST00000174687 650 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Gm27675-201ENSMUST00000184527 94 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Zcwpw2-203ENSMUST00000187803 372 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 5033404E19Rik-202ENSMUST00000194748 1065 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
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