Protein–RNA interactions for Protein: P63072

Ubd, Ubiquitin D, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbdP63072 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UbdP63072 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbdP63072 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbdP63072 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbdP63072 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbdP63072 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbdP63072 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbdP63072 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbdP63072 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbdP63072 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbdP63072 Adgrl3-217ENSMUST00000121707 6690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbdP63072 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbdP63072 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbdP63072 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbdP63072 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
UbdP63072 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
UbdP63072 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbdP63072 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbdP63072 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbdP63072 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
UbdP63072 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbdP63072 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbdP63072 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
UbdP63072 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbdP63072 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbdP63072 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbdP63072 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbdP63072 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbdP63072 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbdP63072 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbdP63072 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbdP63072 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbdP63072 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
UbdP63072 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbdP63072 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbdP63072 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbdP63072 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbdP63072 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbdP63072 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbdP63072 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbdP63072 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbdP63072 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbdP63072 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbdP63072 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbdP63072 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbdP63072 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbdP63072 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbdP63072 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
UbdP63072 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbdP63072 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbdP63072 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbdP63072 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbdP63072 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbdP63072 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbdP63072 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbdP63072 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbdP63072 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbdP63072 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbdP63072 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbdP63072 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbdP63072 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbdP63072 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbdP63072 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbdP63072 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbdP63072 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbdP63072 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbdP63072 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
UbdP63072 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbdP63072 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbdP63072 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbdP63072 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbdP63072 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbdP63072 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbdP63072 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbdP63072 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbdP63072 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbdP63072 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbdP63072 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbdP63072 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbdP63072 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbdP63072 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbdP63072 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbdP63072 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbdP63072 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbdP63072 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbdP63072 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbdP63072 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbdP63072 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbdP63072 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbdP63072 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbdP63072 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbdP63072 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
UbdP63072 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
UbdP63072 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
UbdP63072 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UbdP63072 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
UbdP63072 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UbdP63072 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UbdP63072 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
UbdP63072 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms