Protein–RNA interactions for Protein: P53798

Fdft1, Squalene synthase, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fdft1P53798 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fdft1P53798 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fdft1P53798 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Fdft1P53798 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fdft1P53798 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fdft1P53798 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fdft1P53798 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fdft1P53798 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fdft1P53798 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fdft1P53798 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fdft1P53798 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fdft1P53798 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fdft1P53798 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fdft1P53798 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fdft1P53798 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fdft1P53798 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fdft1P53798 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fdft1P53798 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fdft1P53798 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fdft1P53798 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fdft1P53798 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fdft1P53798 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fdft1P53798 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fdft1P53798 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fdft1P53798 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Fdft1P53798 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fdft1P53798 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fdft1P53798 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fdft1P53798 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fdft1P53798 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fdft1P53798 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Fdft1P53798 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Fdft1P53798 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Fdft1P53798 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fdft1P53798 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fdft1P53798 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fdft1P53798 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fdft1P53798 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fdft1P53798 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fdft1P53798 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fdft1P53798 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fdft1P53798 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fdft1P53798 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fdft1P53798 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fdft1P53798 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fdft1P53798 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fdft1P53798 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fdft1P53798 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fdft1P53798 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fdft1P53798 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fdft1P53798 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fdft1P53798 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Fdft1P53798 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fdft1P53798 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fdft1P53798 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fdft1P53798 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fdft1P53798 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fdft1P53798 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fdft1P53798 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fdft1P53798 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fdft1P53798 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fdft1P53798 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fdft1P53798 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Fdft1P53798 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fdft1P53798 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fdft1P53798 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fdft1P53798 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Fdft1P53798 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Fdft1P53798 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Fdft1P53798 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fdft1P53798 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fdft1P53798 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fdft1P53798 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fdft1P53798 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fdft1P53798 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fdft1P53798 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fdft1P53798 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fdft1P53798 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fdft1P53798 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Fdft1P53798 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Fdft1P53798 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Fdft1P53798 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fdft1P53798 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fdft1P53798 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fdft1P53798 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Fdft1P53798 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Fdft1P53798 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fdft1P53798 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fdft1P53798 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fdft1P53798 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fdft1P53798 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fdft1P53798 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fdft1P53798 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fdft1P53798 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fdft1P53798 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Fdft1P53798 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fdft1P53798 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fdft1P53798 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fdft1P53798 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fdft1P53798 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms