Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
FmodP50608 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
FmodP50608 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
FmodP50608 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
FmodP50608 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
FmodP50608 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
FmodP50608 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
FmodP50608 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
FmodP50608 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
FmodP50608 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
FmodP50608 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
FmodP50608 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
FmodP50608 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
FmodP50608 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
FmodP50608 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
FmodP50608 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
FmodP50608 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
FmodP50608 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
FmodP50608 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
FmodP50608 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
FmodP50608 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
FmodP50608 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
FmodP50608 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
FmodP50608 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
FmodP50608 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
FmodP50608 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
FmodP50608 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
FmodP50608 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
FmodP50608 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
FmodP50608 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
FmodP50608 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
FmodP50608 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
FmodP50608 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
FmodP50608 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
FmodP50608 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
FmodP50608 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
FmodP50608 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
FmodP50608 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
FmodP50608 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
FmodP50608 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
FmodP50608 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
FmodP50608 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
FmodP50608 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
FmodP50608 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
FmodP50608 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
FmodP50608 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
FmodP50608 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
FmodP50608 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
FmodP50608 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
FmodP50608 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
FmodP50608 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
FmodP50608 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
FmodP50608 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
FmodP50608 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
FmodP50608 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
FmodP50608 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
FmodP50608 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
FmodP50608 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
FmodP50608 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
FmodP50608 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
FmodP50608 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
FmodP50608 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
FmodP50608 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
FmodP50608 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
FmodP50608 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
FmodP50608 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
FmodP50608 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
FmodP50608 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
FmodP50608 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
FmodP50608 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
FmodP50608 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
FmodP50608 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
FmodP50608 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
FmodP50608 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
FmodP50608 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
FmodP50608 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
FmodP50608 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
FmodP50608 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
FmodP50608 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
FmodP50608 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
FmodP50608 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
FmodP50608 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
FmodP50608 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
FmodP50608 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
FmodP50608 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
FmodP50608 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
FmodP50608 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
FmodP50608 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
FmodP50608 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
FmodP50608 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
FmodP50608 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
FmodP50608 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
FmodP50608 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
FmodP50608 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
FmodP50608 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
FmodP50608 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
FmodP50608 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
FmodP50608 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
FmodP50608 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
FmodP50608 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms