Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Gm8094-201ENSMUST00000165136 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtprmP28828 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtprmP28828 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Focad-202ENSMUST00000107147 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Fthl17-ps2-201ENSMUST00000122268 528 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Gm21631-201ENSMUST00000195041 754 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Gm9523-201ENSMUST00000199146 1159 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
PtprmP28828 AC132384.2-201ENSMUST00000218018 526 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Gm5194-201ENSMUST00000221457 742 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
PtprmP28828 AC159006.3-201ENSMUST00000226918 664 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Gm10134-201ENSMUST00000074761 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Olfr115-201ENSMUST00000076936 939 ntAPPRIS P2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Csde1-207ENSMUST00000197827 2671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprmP28828 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprmP28828 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Gm5873-201ENSMUST00000177157 1066 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Gm36980-201ENSMUST00000195643 622 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Gm42908-201ENSMUST00000197508 870 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Sparc-208ENSMUST00000214685 1269 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Gm18621-201ENSMUST00000222677 679 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Cacna2d3-208ENSMUST00000225985 918 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Gm22341-201ENSMUST00000083775 129 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprmP28828 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprmP28828 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Gm20052-201ENSMUST00000200831 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprmP28828 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Gm14633-201ENSMUST00000121152 470 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Gm11770-201ENSMUST00000135048 548 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Gm18014-201ENSMUST00000183369 817 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Gm7727-201ENSMUST00000219830 671 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprmP28828 AC133517.1-201ENSMUST00000225825 594 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Gm8618-201ENSMUST00000097570 432 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprmP28828 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprmP28828 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprmP28828 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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