Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PrkchP23298 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PrkchP23298 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
PrkchP23298 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PrkchP23298 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PrkchP23298 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PrkchP23298 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkchP23298 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkchP23298 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkchP23298 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkchP23298 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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