Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

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Length 421 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pou4f1P17208 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pou4f1P17208 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pou4f1P17208 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pou4f1P17208 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pou4f1P17208 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pou4f1P17208 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pou4f1P17208 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pou4f1P17208 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pou4f1P17208 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pou4f1P17208 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pou4f1P17208 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pou4f1P17208 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pou4f1P17208 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pou4f1P17208 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pou4f1P17208 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pou4f1P17208 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pou4f1P17208 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pou4f1P17208 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pou4f1P17208 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pou4f1P17208 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pou4f1P17208 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pou4f1P17208 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pou4f1P17208 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pou4f1P17208 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pou4f1P17208 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Pou4f1P17208 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Pou4f1P17208 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Pou4f1P17208 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pou4f1P17208 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pou4f1P17208 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pou4f1P17208 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Pou4f1P17208 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Pou4f1P17208 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Pou4f1P17208 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Pou4f1P17208 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pou4f1P17208 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pou4f1P17208 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pou4f1P17208 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pou4f1P17208 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pou4f1P17208 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pou4f1P17208 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pou4f1P17208 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pou4f1P17208 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pou4f1P17208 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pou4f1P17208 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pou4f1P17208 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pou4f1P17208 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pou4f1P17208 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pou4f1P17208 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pou4f1P17208 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pou4f1P17208 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pou4f1P17208 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pou4f1P17208 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pou4f1P17208 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pou4f1P17208 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pou4f1P17208 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pou4f1P17208 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pou4f1P17208 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pou4f1P17208 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pou4f1P17208 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Pou4f1P17208 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Pou4f1P17208 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Pou4f1P17208 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pou4f1P17208 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pou4f1P17208 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pou4f1P17208 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pou4f1P17208 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pou4f1P17208 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pou4f1P17208 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pou4f1P17208 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pou4f1P17208 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Pou4f1P17208 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Pou4f1P17208 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pou4f1P17208 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Pou4f1P17208 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pou4f1P17208 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms