Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Ctnnd1-202ENSMUST00000066177 5044 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Bcorl1-203ENSMUST00000136348 7446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Dopey2-201ENSMUST00000045004 7319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Tenm2-202ENSMUST00000102801 9908 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Dysf-215ENSMUST00000204591 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 D030055H07Rik-202ENSMUST00000150953 4325 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Ubr1-201ENSMUST00000028728 7768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Ralgps1-205ENSMUST00000131298 6035 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Fam53c-202ENSMUST00000097622 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Myo15-202ENSMUST00000081823 7953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms