Protein–RNA interactions for Protein: P01667

Ig kappa chain V-III region PC 6308, mousemouse

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01667 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
P01667 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P01667 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
P01667 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P01667 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
P01667 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P01667 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P01667 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P01667 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P01667 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P01667 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P01667 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P01667 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P01667 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P01667 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P01667 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P01667 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P01667 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
P01667 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P01667 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P01667 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P01667 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P01667 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P01667 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P01667 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P01667 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P01667 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01667 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01667 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01667 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01667 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01667 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01667 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01667 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01667 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01667 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01667 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01667 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01667 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
P01667 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
P01667 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01667 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
P01667 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
P01667 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01667 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01667 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01667 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01667 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01667 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01667 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01667 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
P01667 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01667 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01667 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
P01667 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01667 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01667 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01667 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01667 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01667 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01667 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01667 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01667 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01667 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01667 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01667 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01667 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01667 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01667 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01667 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01667 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01667 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01667 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01667 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01667 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
P01667 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01667 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01667 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
P01667 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01667 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01667 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01667 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01667 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01667 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01667 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01667 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
P01667 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
P01667 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
P01667 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
P01667 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
P01667 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
P01667 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
P01667 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
P01667 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
P01667 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
P01667 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P01667 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P01667 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P01667 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P01667 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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