Protein–RNA interactions for Protein: P00375

Dhfr, Dihydrofolate reductase, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DhfrP00375 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Gm43143-201ENSMUST00000196083 2023 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
DhfrP00375 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
DhfrP00375 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
DhfrP00375 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
DhfrP00375 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
DhfrP00375 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
DhfrP00375 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
DhfrP00375 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
DhfrP00375 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms