Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hps1O08983 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hps1O08983 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hps1O08983 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hps1O08983 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hps1O08983 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hps1O08983 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hps1O08983 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Pcdhb19-201ENSMUST00000059571 7138 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hps1O08983 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hps1O08983 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hps1O08983 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hps1O08983 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hps1O08983 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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