Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Speer4b-201ENSMUST00000053257 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Gripap1-201ENSMUST00000065932 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Plekhg5-201ENSMUST00000084115 4113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Polh-201ENSMUST00000024749 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Togaram2-201ENSMUST00000097284 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Adar-205ENSMUST00000121094 2321 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Sap30bpos-201ENSMUST00000132264 2352 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Ogdh-204ENSMUST00000101554 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Gm37447-201ENSMUST00000195625 2928 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
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Smim18J3QNP2 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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Smim18J3QNP2 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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Smim18J3QNP2 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Ccdc148-204ENSMUST00000226455 4612 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Gk2-201ENSMUST00000059657 1880 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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Smim18J3QNP2 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
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Smim18J3QNP2 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Echdc1-201ENSMUST00000020034 3856 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Smyd1-202ENSMUST00000114186 3292 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Mroh3-205ENSMUST00000212798 2933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Cptp-201ENSMUST00000030950 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 A630052C17Rik-201ENSMUST00000129876 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Gm28581-201ENSMUST00000186086 2177 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Slc16a5-202ENSMUST00000106532 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Gm40634-201ENSMUST00000214129 2001 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 AC156802.2-203ENSMUST00000226032 1906 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Atg4b-201ENSMUST00000027502 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Pard3-201ENSMUST00000026921 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Itgal-203ENSMUST00000118405 3909 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
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