Protein–RNA interactions for Protein: J3QN01

Ms4a18, Membrane-spanning 4-domains, subfamily A, member 18, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a18J3QN01 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a18J3QN01 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a18J3QN01 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a18J3QN01 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a18J3QN01 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a18J3QN01 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a18J3QN01 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a18J3QN01 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a18J3QN01 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a18J3QN01 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a18J3QN01 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a18J3QN01 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a18J3QN01 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a18J3QN01 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a18J3QN01 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a18J3QN01 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a18J3QN01 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a18J3QN01 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a18J3QN01 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a18J3QN01 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a18J3QN01 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a18J3QN01 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a18J3QN01 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a18J3QN01 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a18J3QN01 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a18J3QN01 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a18J3QN01 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a18J3QN01 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a18J3QN01 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a18J3QN01 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a18J3QN01 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a18J3QN01 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a18J3QN01 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a18J3QN01 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a18J3QN01 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a18J3QN01 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a18J3QN01 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a18J3QN01 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a18J3QN01 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a18J3QN01 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a18J3QN01 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a18J3QN01 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a18J3QN01 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a18J3QN01 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a18J3QN01 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a18J3QN01 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a18J3QN01 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a18J3QN01 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a18J3QN01 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ms4a18J3QN01 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ms4a18J3QN01 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ms4a18J3QN01 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ms4a18J3QN01 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ms4a18J3QN01 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ms4a18J3QN01 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ms4a18J3QN01 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ms4a18J3QN01 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ms4a18J3QN01 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ms4a18J3QN01 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ms4a18J3QN01 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ms4a18J3QN01 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ms4a18J3QN01 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ms4a18J3QN01 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ms4a18J3QN01 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ms4a18J3QN01 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ms4a18J3QN01 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ms4a18J3QN01 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ms4a18J3QN01 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ms4a18J3QN01 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ms4a18J3QN01 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ms4a18J3QN01 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ms4a18J3QN01 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ms4a18J3QN01 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ms4a18J3QN01 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ms4a18J3QN01 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ms4a18J3QN01 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ms4a18J3QN01 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ms4a18J3QN01 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ms4a18J3QN01 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ms4a18J3QN01 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ms4a18J3QN01 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ms4a18J3QN01 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ms4a18J3QN01 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ms4a18J3QN01 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ms4a18J3QN01 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ms4a18J3QN01 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ms4a18J3QN01 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ms4a18J3QN01 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ms4a18J3QN01 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ms4a18J3QN01 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ms4a18J3QN01 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ms4a18J3QN01 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ms4a18J3QN01 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ms4a18J3QN01 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ms4a18J3QN01 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ms4a18J3QN01 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ms4a18J3QN01 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ms4a18J3QN01 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ms4a18J3QN01 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ms4a18J3QN01 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms