Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3P4

Cenpf, Centromere protein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpfE9Q3P4 Mir9-3hg-202ENSMUST00000181511 3412 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Gm13799-201ENSMUST00000138883 838 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Gm26725-201ENSMUST00000180652 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Gm36980-201ENSMUST00000195643 622 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Gm36307-201ENSMUST00000195831 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Gm3635-201ENSMUST00000212314 354 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Gm7928-201ENSMUST00000181249 701 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Gm29918-201ENSMUST00000205635 138 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Ube4bos3-201ENSMUST00000155845 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Gpx4-ps2-201ENSMUST00000214811 555 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Hesx1-202ENSMUST00000224331 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Gm16227-201ENSMUST00000160088 563 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Chac2-201ENSMUST00000020553 1018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 CT009550.1-201ENSMUST00000225750 864 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Pebp1-201ENSMUST00000036951 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Nt5dc1-202ENSMUST00000099973 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Adgb-201ENSMUST00000045328 1893 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Gm14176-201ENSMUST00000121302 477 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Gm25591-201ENSMUST00000177317 94 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Gm8643-201ENSMUST00000195228 625 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 BB187690-201ENSMUST00000198619 1176 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Gm42732-201ENSMUST00000202887 1197 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 AC102847.1-202ENSMUST00000226313 1245 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Gm16210-201ENSMUST00000122161 610 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 CAAA01125382.3-201ENSMUST00000215277 643 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 164 ms