Protein–RNA interactions for Protein: E9PW80

Gm3298, Predicted gene 3298, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3298E9PW80 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms