Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms