Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Milr1-202ENSMUST00000106794 1514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Brpf1B2RRD7 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Brpf1B2RRD7 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 AU017674-201ENSMUST00000222864 720 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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