Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Gm6880A3KG45 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Gm6880A3KG45 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Gm6880A3KG45 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Gm6880A3KG45 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Gm6880A3KG45 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Gm6880A3KG45 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Gm6880A3KG45 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Gm6880A3KG45 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Gm6880A3KG45 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
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