Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprfA2A8L5 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprfA2A8L5 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprfA2A8L5 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprfA2A8L5 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprfA2A8L5 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprfA2A8L5 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprfA2A8L5 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprfA2A8L5 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprfA2A8L5 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprfA2A8L5 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprfA2A8L5 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprfA2A8L5 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprfA2A8L5 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprfA2A8L5 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprfA2A8L5 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprfA2A8L5 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprfA2A8L5 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprfA2A8L5 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprfA2A8L5 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprfA2A8L5 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprfA2A8L5 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprfA2A8L5 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprfA2A8L5 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprfA2A8L5 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprfA2A8L5 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprfA2A8L5 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprfA2A8L5 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprfA2A8L5 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprfA2A8L5 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprfA2A8L5 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprfA2A8L5 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprfA2A8L5 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprfA2A8L5 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprfA2A8L5 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprfA2A8L5 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprfA2A8L5 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprfA2A8L5 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprfA2A8L5 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprfA2A8L5 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprfA2A8L5 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprfA2A8L5 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprfA2A8L5 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprfA2A8L5 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprfA2A8L5 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprfA2A8L5 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprfA2A8L5 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprfA2A8L5 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprfA2A8L5 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprfA2A8L5 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprfA2A8L5 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprfA2A8L5 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprfA2A8L5 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprfA2A8L5 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprfA2A8L5 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprfA2A8L5 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprfA2A8L5 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprfA2A8L5 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprfA2A8L5 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprfA2A8L5 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprfA2A8L5 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprfA2A8L5 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprfA2A8L5 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprfA2A8L5 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprfA2A8L5 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprfA2A8L5 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprfA2A8L5 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprfA2A8L5 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprfA2A8L5 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprfA2A8L5 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprfA2A8L5 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprfA2A8L5 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprfA2A8L5 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprfA2A8L5 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprfA2A8L5 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprfA2A8L5 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprfA2A8L5 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprfA2A8L5 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprfA2A8L5 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprfA2A8L5 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprfA2A8L5 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprfA2A8L5 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprfA2A8L5 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprfA2A8L5 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprfA2A8L5 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprfA2A8L5 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprfA2A8L5 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprfA2A8L5 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprfA2A8L5 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprfA2A8L5 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprfA2A8L5 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprfA2A8L5 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprfA2A8L5 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprfA2A8L5 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprfA2A8L5 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprfA2A8L5 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprfA2A8L5 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprfA2A8L5 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprfA2A8L5 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprfA2A8L5 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.8 ms