Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 Defb30-202ENSMUST00000111207 989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 Gm15968-201ENSMUST00000119342 1168 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 Gm13571-201ENSMUST00000124654 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 mt-Nd3-201ENSMUST00000082411 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 4933403O08Rik-201ENSMUST00000132037 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 1600019K03Rik-201ENSMUST00000187829 477 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms