Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
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