Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms