Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms