Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWF0

Chaf1a, Chromatin assembly factor 1 subunit A, mousemouse

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Length 911 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chaf1aQ9QWF0 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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