Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms