Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLL3

Tnfrsf19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf19Q9JLL3 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.9 ms