Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB0

Snap29, Synaptosomal-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap29Q9ERB0 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Snap29Q9ERB0 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Snap29Q9ERB0 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Snap29Q9ERB0 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Snap29Q9ERB0 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Snap29Q9ERB0 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Snap29Q9ERB0 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Snap29Q9ERB0 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Snap29Q9ERB0 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Snap29Q9ERB0 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Snap29Q9ERB0 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Snap29Q9ERB0 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Snap29Q9ERB0 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Snap29Q9ERB0 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Snap29Q9ERB0 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Snap29Q9ERB0 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Snap29Q9ERB0 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Snap29Q9ERB0 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Snap29Q9ERB0 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Snap29Q9ERB0 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Snap29Q9ERB0 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Snap29Q9ERB0 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Snap29Q9ERB0 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Snap29Q9ERB0 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Snap29Q9ERB0 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Snap29Q9ERB0 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Snap29Q9ERB0 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Snap29Q9ERB0 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Snap29Q9ERB0 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Snap29Q9ERB0 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Snap29Q9ERB0 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Snap29Q9ERB0 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Snap29Q9ERB0 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Snap29Q9ERB0 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Snap29Q9ERB0 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Snap29Q9ERB0 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Snap29Q9ERB0 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Snap29Q9ERB0 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Snap29Q9ERB0 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Snap29Q9ERB0 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Snap29Q9ERB0 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Snap29Q9ERB0 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Snap29Q9ERB0 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Snap29Q9ERB0 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Snap29Q9ERB0 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Snap29Q9ERB0 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Snap29Q9ERB0 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Snap29Q9ERB0 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Snap29Q9ERB0 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Snap29Q9ERB0 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Snap29Q9ERB0 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Snap29Q9ERB0 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Snap29Q9ERB0 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Snap29Q9ERB0 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Snap29Q9ERB0 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Snap29Q9ERB0 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Snap29Q9ERB0 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Snap29Q9ERB0 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Snap29Q9ERB0 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Snap29Q9ERB0 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Snap29Q9ERB0 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Snap29Q9ERB0 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Snap29Q9ERB0 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Snap29Q9ERB0 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Snap29Q9ERB0 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Snap29Q9ERB0 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Snap29Q9ERB0 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Snap29Q9ERB0 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Snap29Q9ERB0 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Snap29Q9ERB0 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Snap29Q9ERB0 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Snap29Q9ERB0 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Snap29Q9ERB0 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Snap29Q9ERB0 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Snap29Q9ERB0 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Snap29Q9ERB0 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Snap29Q9ERB0 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Snap29Q9ERB0 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Snap29Q9ERB0 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Snap29Q9ERB0 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Snap29Q9ERB0 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Snap29Q9ERB0 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Snap29Q9ERB0 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Snap29Q9ERB0 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Snap29Q9ERB0 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Snap29Q9ERB0 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Snap29Q9ERB0 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Snap29Q9ERB0 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Snap29Q9ERB0 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Snap29Q9ERB0 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Snap29Q9ERB0 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Snap29Q9ERB0 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Snap29Q9ERB0 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Snap29Q9ERB0 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Snap29Q9ERB0 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Snap29Q9ERB0 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Snap29Q9ERB0 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Snap29Q9ERB0 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Snap29Q9ERB0 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Snap29Q9ERB0 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms