Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP93

Vmn1r53, Vomeronasal type-1 receptor 53, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r53Q9EP93 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vmn1r53Q9EP93 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vmn1r53Q9EP93 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vmn1r53Q9EP93 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vmn1r53Q9EP93 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vmn1r53Q9EP93 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vmn1r53Q9EP93 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vmn1r53Q9EP93 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vmn1r53Q9EP93 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Vmn1r53Q9EP93 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vmn1r53Q9EP93 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vmn1r53Q9EP93 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vmn1r53Q9EP93 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vmn1r53Q9EP93 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vmn1r53Q9EP93 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vmn1r53Q9EP93 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vmn1r53Q9EP93 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vmn1r53Q9EP93 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vmn1r53Q9EP93 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vmn1r53Q9EP93 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vmn1r53Q9EP93 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vmn1r53Q9EP93 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vmn1r53Q9EP93 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vmn1r53Q9EP93 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vmn1r53Q9EP93 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r53Q9EP93 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r53Q9EP93 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r53Q9EP93 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r53Q9EP93 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r53Q9EP93 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r53Q9EP93 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r53Q9EP93 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r53Q9EP93 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r53Q9EP93 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r53Q9EP93 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r53Q9EP93 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r53Q9EP93 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Vmn1r53Q9EP93 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Vmn1r53Q9EP93 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Vmn1r53Q9EP93 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r53Q9EP93 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Vmn1r53Q9EP93 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r53Q9EP93 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r53Q9EP93 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r53Q9EP93 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r53Q9EP93 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r53Q9EP93 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r53Q9EP93 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r53Q9EP93 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r53Q9EP93 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r53Q9EP93 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r53Q9EP93 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r53Q9EP93 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r53Q9EP93 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vmn1r53Q9EP93 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vmn1r53Q9EP93 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vmn1r53Q9EP93 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vmn1r53Q9EP93 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vmn1r53Q9EP93 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vmn1r53Q9EP93 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Vmn1r53Q9EP93 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r53Q9EP93 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r53Q9EP93 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r53Q9EP93 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r53Q9EP93 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r53Q9EP93 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r53Q9EP93 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r53Q9EP93 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r53Q9EP93 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r53Q9EP93 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r53Q9EP93 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r53Q9EP93 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r53Q9EP93 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r53Q9EP93 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r53Q9EP93 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r53Q9EP93 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r53Q9EP93 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r53Q9EP93 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r53Q9EP93 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r53Q9EP93 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r53Q9EP93 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r53Q9EP93 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r53Q9EP93 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r53Q9EP93 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r53Q9EP93 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r53Q9EP93 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r53Q9EP93 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r53Q9EP93 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r53Q9EP93 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r53Q9EP93 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r53Q9EP93 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r53Q9EP93 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r53Q9EP93 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r53Q9EP93 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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