Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnft1Q9DCN7 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnft1Q9DCN7 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnft1Q9DCN7 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnft1Q9DCN7 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnft1Q9DCN7 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnft1Q9DCN7 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnft1Q9DCN7 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnft1Q9DCN7 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnft1Q9DCN7 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnft1Q9DCN7 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnft1Q9DCN7 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnft1Q9DCN7 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnft1Q9DCN7 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnft1Q9DCN7 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnft1Q9DCN7 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnft1Q9DCN7 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnft1Q9DCN7 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnft1Q9DCN7 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnft1Q9DCN7 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnft1Q9DCN7 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnft1Q9DCN7 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnft1Q9DCN7 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnft1Q9DCN7 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnft1Q9DCN7 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnft1Q9DCN7 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnft1Q9DCN7 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnft1Q9DCN7 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnft1Q9DCN7 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnft1Q9DCN7 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnft1Q9DCN7 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnft1Q9DCN7 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnft1Q9DCN7 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnft1Q9DCN7 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnft1Q9DCN7 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnft1Q9DCN7 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnft1Q9DCN7 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnft1Q9DCN7 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnft1Q9DCN7 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnft1Q9DCN7 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnft1Q9DCN7 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnft1Q9DCN7 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnft1Q9DCN7 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnft1Q9DCN7 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnft1Q9DCN7 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnft1Q9DCN7 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnft1Q9DCN7 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnft1Q9DCN7 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnft1Q9DCN7 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnft1Q9DCN7 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnft1Q9DCN7 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnft1Q9DCN7 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnft1Q9DCN7 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnft1Q9DCN7 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnft1Q9DCN7 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnft1Q9DCN7 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnft1Q9DCN7 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnft1Q9DCN7 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnft1Q9DCN7 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnft1Q9DCN7 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnft1Q9DCN7 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnft1Q9DCN7 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnft1Q9DCN7 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnft1Q9DCN7 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnft1Q9DCN7 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnft1Q9DCN7 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnft1Q9DCN7 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnft1Q9DCN7 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnft1Q9DCN7 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnft1Q9DCN7 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnft1Q9DCN7 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnft1Q9DCN7 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnft1Q9DCN7 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnft1Q9DCN7 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnft1Q9DCN7 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnft1Q9DCN7 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnft1Q9DCN7 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnft1Q9DCN7 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnft1Q9DCN7 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnft1Q9DCN7 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnft1Q9DCN7 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnft1Q9DCN7 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnft1Q9DCN7 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnft1Q9DCN7 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnft1Q9DCN7 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnft1Q9DCN7 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnft1Q9DCN7 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnft1Q9DCN7 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnft1Q9DCN7 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnft1Q9DCN7 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnft1Q9DCN7 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rnft1Q9DCN7 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnft1Q9DCN7 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnft1Q9DCN7 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnft1Q9DCN7 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnft1Q9DCN7 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnft1Q9DCN7 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnft1Q9DCN7 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnft1Q9DCN7 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnft1Q9DCN7 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms