Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Gm28923-201ENSMUST00000187755 322 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Gm19080-201ENSMUST00000196082 550 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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Smg9Q9DB90 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
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Smg9Q9DB90 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 AC125539.1-201ENSMUST00000227423 622 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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