Protein–RNA interactions for Protein: Q9D995

Cntd1, Cyclin N-terminal domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntd1Q9D995 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cntd1Q9D995 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cntd1Q9D995 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cntd1Q9D995 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cntd1Q9D995 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cntd1Q9D995 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cntd1Q9D995 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cntd1Q9D995 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cntd1Q9D995 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cntd1Q9D995 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cntd1Q9D995 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cntd1Q9D995 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cntd1Q9D995 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cntd1Q9D995 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cntd1Q9D995 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cntd1Q9D995 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cntd1Q9D995 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cntd1Q9D995 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cntd1Q9D995 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cntd1Q9D995 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cntd1Q9D995 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cntd1Q9D995 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cntd1Q9D995 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cntd1Q9D995 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cntd1Q9D995 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cntd1Q9D995 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cntd1Q9D995 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cntd1Q9D995 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cntd1Q9D995 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cntd1Q9D995 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cntd1Q9D995 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cntd1Q9D995 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cntd1Q9D995 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cntd1Q9D995 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cntd1Q9D995 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cntd1Q9D995 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cntd1Q9D995 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cntd1Q9D995 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cntd1Q9D995 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cntd1Q9D995 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cntd1Q9D995 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cntd1Q9D995 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cntd1Q9D995 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cntd1Q9D995 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cntd1Q9D995 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cntd1Q9D995 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cntd1Q9D995 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cntd1Q9D995 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cntd1Q9D995 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cntd1Q9D995 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cntd1Q9D995 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cntd1Q9D995 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cntd1Q9D995 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cntd1Q9D995 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cntd1Q9D995 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cntd1Q9D995 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cntd1Q9D995 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cntd1Q9D995 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cntd1Q9D995 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cntd1Q9D995 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cntd1Q9D995 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cntd1Q9D995 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cntd1Q9D995 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cntd1Q9D995 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cntd1Q9D995 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cntd1Q9D995 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cntd1Q9D995 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cntd1Q9D995 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cntd1Q9D995 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cntd1Q9D995 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cntd1Q9D995 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cntd1Q9D995 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cntd1Q9D995 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cntd1Q9D995 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cntd1Q9D995 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cntd1Q9D995 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cntd1Q9D995 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cntd1Q9D995 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cntd1Q9D995 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cntd1Q9D995 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cntd1Q9D995 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cntd1Q9D995 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cntd1Q9D995 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cntd1Q9D995 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cntd1Q9D995 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cntd1Q9D995 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cntd1Q9D995 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cntd1Q9D995 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cntd1Q9D995 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cntd1Q9D995 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cntd1Q9D995 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cntd1Q9D995 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cntd1Q9D995 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cntd1Q9D995 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cntd1Q9D995 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cntd1Q9D995 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cntd1Q9D995 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cntd1Q9D995 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cntd1Q9D995 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cntd1Q9D995 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.3 ms