Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp4bQ9D8B3 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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