Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms