Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
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