Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Mov10-203ENSMUST00000106775 3584 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Mov10-206ENSMUST00000166979 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Arhgap32-206ENSMUST00000182802 5621 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Afap1-201ENSMUST00000064571 6618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Cd2bp2-203ENSMUST00000205316 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Gm37084-201ENSMUST00000191688 5898 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Txk-201ENSMUST00000113604 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 A130010J15Rik-205ENSMUST00000178744 3782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Man1b1-201ENSMUST00000042390 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Gm37759-201ENSMUST00000194155 3246 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Rnf165-201ENSMUST00000026494 7300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Apobr-201ENSMUST00000039522 3685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Tcn2-206ENSMUST00000109992 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Rnh1-201ENSMUST00000106033 2091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Tesk2-202ENSMUST00000106456 2430 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Palld-201ENSMUST00000034057 3566 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Gys1-201ENSMUST00000003964 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Gm26541-201ENSMUST00000181866 3973 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Helz-201ENSMUST00000075012 6218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Aff1-202ENSMUST00000054979 8323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Prkcd-208ENSMUST00000112211 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Bcor-201ENSMUST00000043441 6113 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Pop1-202ENSMUST00000079028 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Ralgapb-202ENSMUST00000109485 6709 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Wwtr1-202ENSMUST00000120977 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Cfap43-202ENSMUST00000095998 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Btrc-206ENSMUST00000224102 3037 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Stk36-201ENSMUST00000087183 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Pakap-203ENSMUST00000150412 5163 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Tfdp1-204ENSMUST00000209885 2511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Prdm10-204ENSMUST00000215499 6772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Disp2-201ENSMUST00000037547 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Zcchc12-202ENSMUST00000115256 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Pde2a-204ENSMUST00000209537 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Man2c1-211ENSMUST00000160147 3820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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