Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVR1

Gm26657, Predicted gene, 26657 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm26657Q9CVR1 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm26657Q9CVR1 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm26657Q9CVR1 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm26657Q9CVR1 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm26657Q9CVR1 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm26657Q9CVR1 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm26657Q9CVR1 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm26657Q9CVR1 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm26657Q9CVR1 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm26657Q9CVR1 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm26657Q9CVR1 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm26657Q9CVR1 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm26657Q9CVR1 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm26657Q9CVR1 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm26657Q9CVR1 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm26657Q9CVR1 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm26657Q9CVR1 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm26657Q9CVR1 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm26657Q9CVR1 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm26657Q9CVR1 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm26657Q9CVR1 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm26657Q9CVR1 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm26657Q9CVR1 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm26657Q9CVR1 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm26657Q9CVR1 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm26657Q9CVR1 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm26657Q9CVR1 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm26657Q9CVR1 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm26657Q9CVR1 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm26657Q9CVR1 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm26657Q9CVR1 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm26657Q9CVR1 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm26657Q9CVR1 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm26657Q9CVR1 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm26657Q9CVR1 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm26657Q9CVR1 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm26657Q9CVR1 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm26657Q9CVR1 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm26657Q9CVR1 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm26657Q9CVR1 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm26657Q9CVR1 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm26657Q9CVR1 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm26657Q9CVR1 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm26657Q9CVR1 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm26657Q9CVR1 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm26657Q9CVR1 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm26657Q9CVR1 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm26657Q9CVR1 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm26657Q9CVR1 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm26657Q9CVR1 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm26657Q9CVR1 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm26657Q9CVR1 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm26657Q9CVR1 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm26657Q9CVR1 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm26657Q9CVR1 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm26657Q9CVR1 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm26657Q9CVR1 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm26657Q9CVR1 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm26657Q9CVR1 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm26657Q9CVR1 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm26657Q9CVR1 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm26657Q9CVR1 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm26657Q9CVR1 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm26657Q9CVR1 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm26657Q9CVR1 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm26657Q9CVR1 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm26657Q9CVR1 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm26657Q9CVR1 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm26657Q9CVR1 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm26657Q9CVR1 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm26657Q9CVR1 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm26657Q9CVR1 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm26657Q9CVR1 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm26657Q9CVR1 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm26657Q9CVR1 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm26657Q9CVR1 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm26657Q9CVR1 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm26657Q9CVR1 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm26657Q9CVR1 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm26657Q9CVR1 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm26657Q9CVR1 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm26657Q9CVR1 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm26657Q9CVR1 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm26657Q9CVR1 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm26657Q9CVR1 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm26657Q9CVR1 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm26657Q9CVR1 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm26657Q9CVR1 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm26657Q9CVR1 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm26657Q9CVR1 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm26657Q9CVR1 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm26657Q9CVR1 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm26657Q9CVR1 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm26657Q9CVR1 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm26657Q9CVR1 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm26657Q9CVR1 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm26657Q9CVR1 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm26657Q9CVR1 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm26657Q9CVR1 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm26657Q9CVR1 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.1 ms