Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

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Length 731 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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