Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.2 ms